តើម៉ាស៊ីន centrifuge បំបែក DNA ពីប្រូតេអ៊ីនដែរឬទេ?
សេចក្តីផ្តើម
ការបង្វិលជាបច្ចេកទេសសំខាន់មួយដែលត្រូវបានគេប្រើយ៉ាងទូលំទូលាយក្នុងការស្រាវជ្រាវវិទ្យាសាស្ត្រ និងមន្ទីរពិសោធន៍គ្លីនិក សម្រាប់ការបំបែកសមាសធាតុផ្សេងៗនៃគំរូដោយផ្អែកលើដង់ស៊ីតេរបស់វា។ ការអនុវត្តទូទៅមួយនៃបច្ចេកទេសនេះពាក់ព័ន្ធនឹងការញែក DNA និងប្រូតេអ៊ីនចេញពីគំរូជីវសាស្ត្រដែលបានផ្តល់ឲ្យ។ នៅក្នុងអត្ថបទនេះ យើងនឹងស្វែងយល់ថាតើម៉ាស៊ីនបង្វិលមានសមត្ថភាពបំបែក DNA ពីប្រូតេអ៊ីនបានយ៉ាងមានប្រសិទ្ធភាពឬអត់ និងស្វែងយល់ពីវិធីសាស្ត្រផ្សេងៗដែលប្រើដើម្បីសម្រេចបាននូវការបំបែកប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាព។
ការយល់ដឹងអំពីម៉ាស៊ីនបង្វិល
មុននឹងស្វែងយល់ពីលក្ខណៈជាក់លាក់នៃការបំបែក DNA ចេញពីប្រូតេអ៊ីនដោយប្រើម៉ាស៊ីន centrifuge វាជាការសំខាន់ណាស់ក្នុងការយល់ដឹងអំពីគោលការណ៍ជាមូលដ្ឋាននៃការ centrifuge។ ម៉ាស៊ីន centrifuge ដំណើរការលើគោលការណ៍នៃការตกตะกอน ហើយប្រើប្រាស់ការបង្វិលល្បឿនលឿនដើម្បីបង្កើតកម្លាំង centrifugal ខ្លាំង។ កម្លាំងនេះបណ្តាលឱ្យភាគល្អិតនៅក្នុងគំរូបំបែកចេញពីគ្នាដោយផ្អែកលើដង់ស៊ីតេរបស់វា ដោយភាគល្អិតក្រាស់ជាងធ្វើចំណាកស្រុកទៅបាតបំពង់គំរូ។ ជាលទ្ធផល ភាគល្អិតស្រាលជាងច្រើនតែនៅខាងលើ។
បញ្ហាប្រឈមនៃការបំបែក DNA និងប្រូតេអ៊ីន
នៅពេលនិយាយអំពីការបំបែក DNA និងប្រូតេអ៊ីន វាបង្កបញ្ហាប្រឈមមួយ ដោយសារម៉ូលេគុលទាំងពីរមានទម្ងន់ម៉ូលេគុលស្រដៀងគ្នា។ បើគ្មានបច្ចេកទេសបំបែកដែលមានប្រសិទ្ធភាពទេ វាពិបាកក្នុងការទទួលបានគំរូ DNA ឬប្រូតេអ៊ីនសុទ្ធ។ ទោះជាយ៉ាងណាក៏ដោយ ការបង្វិលកណ្តាលអាចជួយក្នុងដំណើរការបំបែក ប៉ុន្តែវាប្រហែលជាមិនគ្រប់គ្រាន់ដោយខ្លួនវាទេ។
១. ការបង្វិលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ការបំបែកដំបូង
២. ការបង្វិលជុំខ្លាំង៖ ការបំបែកដែលប្រសើរឡើង
៣. ការបង្វិលជុំដង់ស៊ីតេជម្រាល៖ ការកែលម្អដំណើរការ
៤. សារៈសំខាន់នៃការជ្រើសរើសសតិបណ្ដោះអាសន្ន
៥. ការបង្វិលកណ្តាលទល់នឹងបច្ចេកទេសបំបែកផ្សេងទៀត
ការបង្វិលឌីផេរ៉ង់ស្យែល៖ ការបំបែកដំបូង
ការបង្វិលឌីផេរ៉ង់ស្យែលគឺជាជំហានដំបូងក្នុងការបំបែក DNA ចេញពីប្រូតេអ៊ីន។ វិធីសាស្ត្រនេះប្រើប្រាស់ល្បឿនបង្វិលខុសៗគ្នា ដើម្បីសម្រេចបាននូវការបំបែកសមាសធាតុកោសិកាយ៉ាងទូលំទូលាយ។ ក្នុងអំឡុងពេលនៃនីតិវិធីនេះ កោសិកា ឬគំរូជាលិកាដែលមានលក្ខណៈដូចគ្នា ត្រូវបានទទួលរងនូវការបង្វិលល្បឿនទាប ជាធម្មតាប្រហែល 1000-5000 បដិវត្តន៍ក្នុងមួយនាទី (rpm)។ ការបង្វិលល្បឿនទាបនេះអាចឱ្យមានការបំបែកស្នូល និងកោសិកាដែលមិនទាន់ខូច ដែលនាំឱ្យមានការបំបែកឆៅ។ ទោះជាយ៉ាងណាក៏ដោយ វាមិនផ្តល់នូវការបំបែក DNA និងប្រូតេអ៊ីនទាំងស្រុងនោះទេ។
ការបង្វិលជុំខ្លាំង៖ ការបំបែកដែលប្រសើរឡើង
ដើម្បីយកឈ្នះលើដែនកំណត់នៃការបង្វិលកណ្តាលឌីផេរ៉ង់ស្យែល ការបង្វិលកណ្តាលខ្លាំងបានចូលមកក្នុងឆាក។ ការបង្វិលកណ្តាលខ្លាំងគឺជាម៉ាស៊ីនបង្វិលកណ្តាលល្បឿនលឿនដែលមានសមត្ថភាពឈានដល់ល្បឿនរហូតដល់ 100,000 rpm។ តាមរយៈការធ្វើឱ្យប្រភាគឆៅដែលទទួលបានពីការបង្វិលកណ្តាលល្បឿនទាបដំបូងទៅជាការបង្វិលកណ្តាលខ្លាំង កម្រិតខ្ពស់នៃការបំបែករវាង DNA និងប្រូតេអ៊ីនអាចសម្រេចបាន។ ម៉ូលេគុល DNA ធ្ងន់ៗធ្លាក់ទៅបាតបំពង់ បង្កើតជាគ្រាប់ដែលអាចមើលឃើញ ខណៈពេលដែលប្រូតេអ៊ីននៅតែស្ថិតក្នុងសារធាតុរាវខាងលើ។
ការបង្វិលកម្លាំងដង់ស៊ីតេ៖ ការកែលម្អដំណើរការ
ដើម្បីកែលម្អការបំបែក DNA និងប្រូតេអ៊ីនបន្ថែមទៀត ការបង្វិលជុំជម្រាលដង់ស៊ីតេត្រូវបានប្រើប្រាស់។ នៅក្នុងបច្ចេកទេសនេះ ឧបករណ៍បង្វិលជម្រាលដង់ស៊ីតេ ដូចជាស៊ុយក្រូស ឬសេស្យូមក្លរួ ត្រូវបានរៀបចំ។ ឧបករណ៍នេះមានជួរដង់ស៊ីតេជាច្រើន ដែលកើនឡើងពីកំពូលទៅបាតនៃបំពង់បង្វិលជុំ។ ប្រភាគឆៅដែលទទួលបានពីជំហានមុនត្រូវបានដាក់ជាស្រទាប់ដោយប្រុងប្រយ័ត្ននៅលើកំពូលនៃជម្រាលដង់ស៊ីតេ ហើយទទួលរងនូវការបង្វិលជុំខ្លាំងម្តងទៀត។ DNA និងប្រូតេអ៊ីនបំបែកចេញពីគ្នាដោយផ្អែកលើដង់ស៊ីតេរបស់វា ហើយបង្កើតជាក្រុមផ្សេងៗគ្នានៅក្នុងជម្រាល។ ការបំបែកនៃជម្រាលអនុញ្ញាតឱ្យមានការស្តារឡើងវិញនូវគំរូ DNA និងប្រូតេអ៊ីនសុទ្ធ។
សារៈសំខាន់នៃការជ្រើសរើសសតិបណ្ដោះអាសន្ន
សារធាតុរក្សាលំនឹងដែលប្រើក្នុងអំឡុងពេលបង្វិលកណ្តាលដើរតួនាទីយ៉ាងសំខាន់ក្នុងការសម្រេចបាននូវការបំបែកប្រកបដោយប្រសិទ្ធភាព។ វាប៉ះពាល់ដល់ស្ថេរភាព និងភាពសុចរិតនៃម៉ូលេគុលដែលកំពុងត្រូវបានបំបែក។ ចំពោះ DNA សារធាតុរក្សាលំនឹង Tris-EDTA ដែលមាន pH 8.0 ត្រូវបានគេប្រើជាទូទៅដោយសារសមត្ថភាពរបស់វាក្នុងការរក្សាស្ថេរភាព DNA។ ម្យ៉ាងវិញទៀត ប្រូតេអ៊ីនត្រូវការសារធាតុរក្សាលំនឹងដែលមានកម្រិត pH ជាក់លាក់ ជាធម្មតាប្រហែល 7.0 ដើម្បីការពារការខូចគុណភាព និងរក្សារចនាសម្ព័ន្ធដើមរបស់វា។ ការជ្រើសរើសសារធាតុរក្សាលំនឹងសមស្របធានានូវការបំបែក DNA និងប្រូតេអ៊ីនបានត្រឹមត្រូវដោយមិនធ្វើឲ្យខូចគុណភាពរបស់វា។
ការបង្វិលកណ្តាលទល់នឹងបច្ចេកទេសបំបែកផ្សេងទៀត
ខណៈពេលដែលការបង្វិលកណ្តាលគឺជាបច្ចេកទេសដែលប្រើប្រាស់យ៉ាងទូលំទូលាយក្នុងការបំបែក DNA ចេញពីប្រូតេអ៊ីន វាជាការសំខាន់ក្នុងការទទួលស្គាល់ថាវាអាចមិនមែនជាវិធីសាស្ត្រតែមួយគត់ដែលប្រើនោះទេ។ បច្ចេកទេសផ្សេងទៀត ដូចជា chromatography, electrophoresis និង precipitation អាចបំពេញបន្ថែមការបង្វិលកណ្តាលដើម្បីសម្រេចបាននូវការបំបែកដែលកាន់តែចម្រាញ់។ បច្ចេកទេសនីមួយៗមានគុណសម្បត្តិ និងដែនកំណត់រៀងៗខ្លួន ហើយអ្នកស្រាវជ្រាវជារឿយៗផ្សំវិធីសាស្ត្រច្រើនដើម្បីទទួលបានភាពបរិសុទ្ធ និងការស្តារ DNA និងប្រូតេអ៊ីនដែលចង់បាន។
សេចក្តីសន្និដ្ឋាន
សរុបមក ខណៈពេលដែលម៉ាស៊ីនបង្វិលពិតជាមានប្រយោជន៍សម្រាប់ការបំបែក DNA ចេញពីប្រូតេអ៊ីន វាដំណើរការបានល្អបំផុតនៅពេលភ្ជាប់ជាមួយបច្ចេកទេសផ្សេងទៀត។ ការបង្វិលឌីផេរ៉ង់ស្យែល ការបង្វិលជ្រុល និងការបង្វិលជម្រាលដង់ស៊ីតេបង្កើតបានជាជំហានបំបែកជាបន្តបន្ទាប់ដែលជួយក្នុងការទទួលបានគំរូបរិសុទ្ធជាងមុន។ លើសពីនេះ ការជ្រើសរើសសារធាតុរាវសតិបណ្ដោះអាសន្នសមស្រប និងការពិចារណាលើបច្ចេកទេសបំបែកផ្សេងទៀត បង្កើនប្រសិទ្ធភាពរួមនៃការបំបែក DNA-ប្រូតេអ៊ីន។
។